除了入关之人和入关后投降的人之外，调查八旗汉军时，还必须关注一支特种部队在这支军队中，也就是我们通常所说的“三顺王、徐顺公”的人员编制变动。所谓“三顺王”、“徐顺公”，是指清太宗时期先后投降清朝和后金的明朝将领孔有德、耿仲明、尚可喜、沈志祥。王朝太极天聪、崇德。孔、庚、商三王和徐顺公沉志祥及其亲属虽然在清初已被编入八旗汉军，但他们的部队并不隶属于八旗汉军。他们与八旗汉军只是在组织、待遇等方面有相似之处。

后来投降的三王、徐顺公、吴三桂领导的旧部队，是一个特殊的军事组织，既不是八旗，也不是绿营。这是清初统治者实行独特的诱用降兵将领政策的结果。直到“三藩之乱”，他们的旧部族后裔以及三王、徐顺公才被纳入八旗。这也是康熙朝八旗汉族武辅人数大幅增加的重要原因之一。

这里重点讨论三藩之乱后编入八旗汉军的所谓“叛乱”，以及他们在乾隆时期八旗汉军大规模浪潮中扮演的角色王朝。康熙帝平定“三仇”叛乱后，吴三桂的部队除威胁他的人外，均被派往边远地区行军。他们被当作罪犯对待，没有被编入半秀。此外，还有孔有德、耿精忠、尚可喜等人的残余。由于他们的实力被大大削弱，“诸侯之下的部落也分了旗号”。

至此，三顺王、徐舜公的残部就完全融入汉军之中了。徐顺王、申知祥及其亲属分别重组的八旗汉军辅助首领，分别较早入旗，在汉军出旗过程中基本保持稳定。例如，康熙二十二年（1683年）十二月，“将明尚志孝、尚志龙等家族的壮士，分为五副领，划归镶黄旗汉军旗下”。据朱《钦定八旗通志-旗份志》记载，乾隆六十年商氏所拥有的五个属领仍然存在，而其他三王的属领并没有减少。这说明，在削减八旗和汉军的过程中，三顺王、徐顺公沈志祥本人以及他们的亲属组建的幕僚似乎并没有受到影响。至于原本隶属诸侯的普通士兵，被分配到各地驻守汉军后，在乾隆裁减汉军期间并没有得到优待。他们与驻守各地的八旗汉军一起为人民服务。